El Manchester City ha sumado a Álex Baena a su lista de posibles sucesores de Kevin De Bruyne en caso de que el belga se marche en verano, según apunta Fichajes.net. Según esta fuente, el club de la Premier League está considerando seriamente la opción de fichar al creador de juego del Villarreal de 22 años como parte de su planificación a futuro.
Álex Baena debutó como sénior con el Villarreal C. F. «C» el 21 de diciembre de 2018, en un partido de la Tercera División frente al Rayo Ibense. Al Villarreal llegó desde el C. D. Roquetas. En la temporada 2019-20 ascendió al Villarreal C. F. «B», debutando en Segunda División B el 14 de septiembre de 2019, en la victoria de su equipo por 3-0 frente a la U. E. Llagostera. En esta temporada, y dado su progresión, también logró debutar con el primer equipo del Villarreal C. F., en un partido de la Primera División frente a la Real Sociedad, y el 22 de octubre de 2020 disputó su primer partido en competición europea, en la Liga Europa de la UEFA 2020-21, en la victoria del Villarreal por 5-3 frente al Sivasspor.
En agosto de 2021 abandonó temporalmente el equipo castellonense para jugar cedido en el Girona. Con este equipo consiguió el ascenso a Primera División, marcando un gol en el partido definitivo ante el C. D. Tenerife. Después de ello regresó a Villarreal, y el 13 de agosto, en la primera jornada del campeonato liguero, logró anotar dos tantos en el triunfo ante el Real Valladolid.